小球藻加工成片剂或胶囊能高度保持藻体的营养与生物活性成分，故一直在保健食品市场占据主导地位。
小球藻保健饮料、乳酸奶及茶等具有特色的健康饮品，其特有小球藻生长因子（CGF），有益身体健康。
把小球藻添加到其他食品原料中混合，可加工制成面条、面包、香口胶、糕点 、糖果、冰激凌、豆腐等。
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