从马铃薯细胞中分离出来的水就是所谓的马铃薯细胞液汁水，马铃薯细胞液汁水中固形物约占4-6%。其中含氮化合物占1.6-2.1%，含氮物中50%是蛋白质。马铃薯蛋白是马铃薯细胞汁水干物质的主要成分。细胞液汁水中固形物含有大量的优级马铃薯蛋白。通常细胞液水中65%的蛋白在这一阶段被回收。
由于生产废水中含有蛋白，所以很容易产生大量泡沫；如果废水不及时处理含有蛋白的废水会发臭，直接排放可能造成环境污染。
从马铃薯淀粉加工车间多级旋流站溢流出来的马铃薯细胞液中含有可溶蛋白和不可溶蛋白，对于可溶性蛋白我们通过特殊的絮凝提取技术，将蛋白从水溶液中提取出来。
首先根据蛋白质在等电点时溶解度的原理，可以沉淀一部分蛋白质。因此在马铃薯细胞液中加入一定量的盐酸，调节溶液的pH值到蛋白质的等电点，在等电点时部分蛋白质会沉淀析出。
由于不同的蛋白质其等电点不同，所以不能只靠等电点沉淀。在析出部分蛋白质后，我们采用蛋白质热凝固方法对溶液中的蛋白质继续提取，达到提取蛋白质。
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